西南林业大学和云南农业大学两所学校其实“同宗同源”，都来自老云南大学。云南大学解放前就已经成立，当时云南省以农业为主，所以在农林方向教研功底深厚，而且云南大学基本未受到抗战的影响，因此农学方面实力较强。先后有四川大学、西南大学获得了云南大学的农学专业。1954年，云南大学农学院彻底独立，改建为昆明农林学院。
后来，昆明农林学院分拆，农学部分就是目前的云南农业大学
，林学部分就是目前的西南林业大学。之所以昆明农林学院会被分拆，这主要是因为北京林业大学引起的。1969年开始国际形势对我国不利，中央考虑要打仗，因此将十三所京校外迁，这其中就包括北京林业大学。而北京林业大学外迁对象就是云南省。但是北林实在太大了，而且要求还比较高，所以先后迁到丽江、下关都没有留住北林，最终选择了贵阳。
北京林业大学迁至贵阳，总需要一个办学地点和实践场所吧，这就需要昆明农林学院将林学资源贡献出来。而北京林业大学当时的实力要比昆明农林学院强大的多，为了要留住北林在云南长期发展，就特意将昆明农林学院拆分，林学专业和涉及林学的资产，全部划归北林所有，使其更名为云南林业学院，能一门心思扎根云南。事情都做了，努力也付出了，可惜依旧没有留住北林，1979年北林依旧回迁北京，复名北京林学院，也就是今天的北京林业大学。
西南林业大学和云南农业大学其实是“一母同胞”，为了留住“大佬”而分家，但是付出并没有换来回报，北林也就选择了离开，这就是典型的“人往高处走，水往低处流”。整体来看，云南农业大学的综合实力略胜西南林业大学一点，这主要是因为云南农业大学折腾得比较少，没有过多的分分合合所致。
