马克笔和水彩笔在笔头、种类、用途、价格、颜色、效果等方面都有明显的差别。水彩笔又称绘画笔，是一种绘画工具，一般适合画儿童画，也可以用作记号笔;马克笔又称记号笔，是一种书写或绘画专用的绘图彩色笔。
1、笔头
水彩笔的笔头一般是圆形的，适合大面积涂色。马克笔一般有细头、软头和粗头三种笔头，不同的笔头有不同的用法，例如细头适合勾线，粗头适合涂色。
2、种类
水彩笔有单色水彩笔、双色水彩笔和多色水彩笔三种，不同种类的水彩笔也有12色、24色、36色等多种规格之分。马克笔一般分为油性马克笔和水性马克笔两种。
3、用途
水彩笔多用于勾勒线条和画儿童画，其画出来的画过渡效果非常不自然，一般从远处看的效果比从近处看的效果要好。马克笔通常用于绘制建筑效果图、工业设计效果图、广告图等，水性马克笔沾水以后在纸上涂抹的效果和水彩差不多。
4、价格
同一品牌、同等规格下的产品，马克笔的价格一般要高于水彩笔。
5、颜色
水彩笔一般是12色、24色、36色一盒装卖，马克笔则可以分开买，只买一种颜色也可以。叠色方面，马克笔可以叠色，水彩笔不能叠色。
6、效果
水彩笔画出来的画比较粗糙，着色不均匀，一般是非专业作画使用。马克笔的绘画效果要好很多，并且能通过叠色画出渐变的效果，还能利用马克笔的笔触表现高光、阴影等多种效果，更专业化。
三、马克笔和水彩笔哪个好
马克笔和水彩笔各有各的优缺点，相对来说，马克笔的笔头、类型、色号更多，叠色效果也更好，用途更广，绘图效果也更好，虽然价格更贵，但是作用也非常多；不过对于儿童绘画来说，水彩笔更合适，因此具体如何选择要看实际用途。
