清同治十三年十二月初五(公元1875年1月12日)，同治皇帝驾崩于北京紫禁城养心殿，终年19岁。对于同治小皇帝的死因，向来众说纷纭，野史演义中最广为流传的版本说他是死于一种见不得人的“不洁之症”——花柳病。
那么，真相究竟如何呢?末代皇帝溥仪在他的回忆录《我的前半生》里有所阐述。溥仪虽非亲生经历，但他祖父醇亲王奕譞颇知内情，他入宫为帝后又常听老太监提及此事，所以可信度还是很高的。
首先，同治帝死于花柳病的说法并不可信，据溥仪所知同治帝是死于天花，这一点与帝师翁同龢日记所载一致。但是即便是在清朝，天花也并非必死之症，先祖康熙帝也得过天花，但最终还是好了。既然如此，200多年过去了，同治帝为什么偏偏就治不好了呢?对此，慈禧太后负有不可推卸的责任。
早在同治帝驾崩前，他与母亲慈禧太后失和就已经是公开的秘密，原因众所周知，慈禧大权独揽，小皇帝无法亲政。据清宫老太监回忆，同治帝生前与慈安太后亲厚有加，二人经常一处聊天，但对于亲生母亲慈禧，同治帝除了必要的请安，从不与之多说一句话。
更要命的是，慈禧太后还非常不喜欢同治的孝哲毅皇后，经常打骂刁难她。同治皇帝患天花后在养心殿养病，一次皇后前去探望，同治帝见皇后面色难看，似乎刚哭过，便问其缘由。皇后一时忘情，就在同治面前说起慈禧责骂侮辱她的事，期间不禁失声痛哭。同治爱妻心切，又素知慈禧的为人，于是细语劝皇后先忍着，总会有出头的日子。
怎料夫妻俩的悄悄话被躲在养心殿东暖阁外的慈禧听了个一清二楚，只见慈禧怒气冲冲闯了进来，抓住皇后的头发，当着同治皇帝的面，抬手就给了好几个耳光，并命令内廷准备棍杖大刑伺候。同治帝眼看着爱妻受此重责凌辱，又在大病期间，于是立刻就昏厥了过去。同治皇帝受此刺激，天花上添了“痘内陷”的病变，很快就一命呜呼了。
这还不算完，慈禧又把同治帝的死怪罪到皇后头上，把皇后关了起来，不准人送饭。就这样，两个月后皇后也死了。随后，慈禧又把皇后的父亲崇绮也给革职了。
慈禧是一个极度贪图权力的女人，这种对权力的贪恋甚至让她泯灭人伦，丧失了作为一个母亲起码的爱与怜悯。
