牡蛎和生蚝不是同一种食物。区别主要表现为：外观不同，营养价值不同，吃法不同。
牡蛎在北方常被称作海蛎子、牡蛎，而在南方无论生熟都叫生蚝，也有叫“蛎黄”或者“蚵”(he)的，如闽南地区有名小吃“蚵仔煎”。因为牡蛎和生蚝长得一样，所以很多人都认为它们是一种，只是叫法不一样。而事实是，这两种东西确实不一样，或者可以这样理解，生蚝和牡蛎属于同种，不同类。
生蚝是牡蛎品种里面个头比较大的一种，一般较大的生蚝带壳都能在1斤以上。其主要生长在江河与大海的交汇处，或是半咸半淡的内湾浅海处。由于生长条件的限制，它的数量相对于其它牡蛎品种要少很多。随着市场需求的增加，这类生蚝开始被大面积养殖，因此人们餐桌上的大部分生蚝都是人工养殖。
营养
都说生蚝是“男人的加油站，女人的美容院”，这是因为它含有丰富的微量元素“锌”(人类食物含锌之首)。当然，这只针对的是生蚝，而不是所有牡蛎。每100g生蚝就含有71.2 mg的锌，而同样重量的牡蛎却只有9.39mg的含量，生蚝的锌含量足足高出了普通牡蛎7.6倍。而且蚝肉中的蛋白质含量也高达40%，所以常被人称为“海中牛奶”。因此，很多人所说含锌量“最高”的牡蛎是指“生蚝”，而不是一般的牡蛎。
吃法
生蚝的吃法有很多，最常见的有清蒸、炭烤、刺身等。个人觉得最佳的吃法要属清蒸，不仅干净卫生，而且味道极其鲜美。由于生蚝离开海水以后最多只能存活1-2周时间，所以鲜食生蚝的话，一定要在这个时间内吃完。生蚝喜冷不喜热，如果有吃不完的生蚝，建议放在0-5℃的环境中保存，只要表面保持潮湿即可，不必浸泡在水中。
三倍体
自然界野生的牡蛎都是二倍体，直到1993年，美国教授郭希明和斯坦迪什·艾伦教授，他们用普通的二倍体的牡蛎和育种倍增的四倍体长牡蛎杂交，培育出了三倍体的长牡蛎。这种三倍体牡蛎每年体重多增30%，个头也是普通牡蛎的2-3倍，而且抗逆性强，不易生病，营养也和生蚝一样。我国的三倍体牡蛎早在1999年就已经育苗成功，目前在山东、辽宁都有养殖基地。
