国家二级保护动物有小熊猫、穿山甲、黑熊、天鹅、鹦鹉、短尾猴、藏酋猴、豺、亚洲黑熊、小熊猫、石貂、黄喉貂、水獭、亚洲小爪水獭、斑林狸、大灵猫、小灵猫、草原斑猫、荒漠猫、丛林猫、猞猁、兔狲、亚洲金猫、渔猫、河麂[hé jǐ]、马鹿、白臀鹿、水鹿、驼鹿[tuó lù]、斑羚、鬣羚[liè líng]等共230多种。
1、兽纲：短尾猴、猕猴、藏酋猴、穿山甲、豺、黑熊、棕熊（包括马熊）、石貂、水獭（所有种）、小爪水獭、斑林狸、小灵猫、大灵猫、草原斑猫、荒漠猫、丛林猫、猞猁、兔狲、金猫、渔猫、其他鲸类、麝（所有种）、河麂、马鹿（包括白臀鹿）、水鹿、驼鹿、黄羊、藏原羊、鹅喉羚、鬣羚、斑羚、岩羊、盘羊、海南兔、雪兔、塔里木兔、巨松鼠。
2、鸟纲：角、赤颈、鹈鹕（所有种）、鲣鸟（所有种）、海鸬鹚、黑颈鸬鹚、黄嘴白鹭、岩鹭、海南虎斑（开鸟）、小苇（开鸟）、彩鹳、彩鹮、白琵鹭、黑脸琵鹭、红胸黑雁、白额雁、天鹅（所有种）、鸳鸯、其他鹰类、隼科（所有种）、黑琴鸡、柳雷鸟、岩雷鸟、镰翅鸟、花尾榛鸡、雪鸡（所有种）等。
二级保护动物受国家法律保护，根据国家《野生动物保护法》规定：按照违法行为程度（动物数量）分类：一般行为，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；情节严重的，处五年以上十年以下有期徒刑，并处罚金;情节特别严重的，处十年以上有期徒刑，并处罚金或者没收财产。根据国家《野生动物保护法》规定：按照违法行为程度分类：一般行为，处五年以下有期徒刑或者拘役，并处罚金；情节严重的，处五年以上十年以下有期徒刑，并处罚金;情节特别严重的，处十年以上有期徒刑，并处罚金或者没收财产。
