截至2021年12月31日，清华大学设有21个学院，59个系，开设87个本科专业。
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院（系）名称
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专业名称
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建筑学院
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建筑学
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城乡规划
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风景园林
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建筑环境与能源应用工程
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土木水利学院
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土木工程
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工程管理
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交通工程
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水利水电工程
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水利科学与工程
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土木、水利与海洋工程
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环境学院
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环境工程
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环境工程（全球环境国际班）
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给排水科学与工程
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机械工程学院
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机械工程
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机械工程（实验班）
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测控技术与仪器
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微机电系统工程
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车辆工程
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车辆工程（汽车造型与车身设计方向）
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工业工程
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能源与动力工程
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航天航空学院
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能源与动力工程
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工程力学
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工程力学（钱学森力学班）
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航空航天工程
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航空航天工程(飞行员班)
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电机工程与应用电子技术系
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电气工程及其自动化
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电气工程及其自动化（能源互联网）
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信息科学技术学院
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电子信息科学与技术
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电子信息工程
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电子科学与技术
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微电子科学与工程
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自动化
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软件工程
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计算机科学与技术
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交叉信息研究院
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计算机科学与技术（计算机科学实验班）
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计算机科学与技术（人工智能班）
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工程物理系
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工程物理
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工程物理（能源实验班）
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核工程与核技术
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化学工程系
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高分子材料与工程
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化学工程与工业生物工程
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材料学院
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材料科学与工程
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理学院
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数学与应用数学
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信息与计算科学
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数理基础科学
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物理学
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应用物理学
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化学
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化学生物学
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生命学院
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生物科学
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生物技术
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公共管理学院
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行政管理
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经济管理学院
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信息管理与信息系统
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会计学
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经济与金融
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工商管理
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金融学
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经济学
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社会科学学院
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经济学
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社会学
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国际政治
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国际政治（国际事务与全球治理）
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心理学
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政治学与行政学
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人文学院
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哲学
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历史学
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汉语言文学
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英语
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英语（世界文学与文化实验班）
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日语
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法学院
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法学
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法 学（国际班）
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新闻与传播学院
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新闻学
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美术学院
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广告学
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艺术史论
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动画
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绘画
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雕塑
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摄影
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中国画
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艺术设计学
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视觉传达设计
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环境设计
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产品设计
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服装与服饰设计
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公共艺术
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工艺美术
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数字媒体艺术
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艺术与科技
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陶瓷艺术设计
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工业设计
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药学院
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药学
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医学院
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生物医学工程
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临床医学
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北京协和医学院－清华大学医学部
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临床医学
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新雅书院
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政治学、经济学与哲学
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作为全国最顶尖的大学之一，清华大学的专业也有热门与冷门之分，这是客观存在的事实。从家长和考生的角度看，姚期智计算机科学实验班、钱学森力学班、数理基础科学班等学科（专业），深受学子们欢迎。
据了解，“清华学堂计算机科学实验班”，简称“姚班”，由世界著名计算机科学家姚期智院士于2005年创办，其主要培养目标是培养出与美国麻省理工学院、普林斯顿大学等世界一流大学本科学生具有同等、甚至更高竞争力的领跑国际拔尖创新计算机科学人才。
“清华学堂人才培养计划”钱学森力学班，简称“钱学森班”或“清华钱班”。钱学森力学班创立于2009年，是国家“基础学科拔尖学生培养试验计划”唯一定位于工科基础的试验班。其办学目标和使命是：发掘和培养有志于通过技术改变世界、造福人类的创新型人才，探索回答“钱学森之问”。
数理基础科学班创办于1998年，是清华大学为加强基础科学教学与研究而创办的一个跨系跨学科的教学试验计划。通过强化数学和物理学的教学，基础科学班的本科学生应掌握扎实的数学与物理学基础理论，并具有较强的物理实验技能和接受一定的科学研究的实际训练。
数理基础科学班2005年转为国家理科人才培养正式基地。该班以培养高层次数理后备人才为目标，加强物理及数学的理论课程教学，使毕业生具有全面、扎实的物理学、数学基础理论和实验技能、熟练的计算机应用能力和较高的外语水平，成为”基础厚、口径宽、能力强、素质高”的综合性人才。
